MIN Bekasi menerapkan kombinasi antara **Kurikulum Nasional (Kurikulum Merdeka)** yang dikembangkan oleh Kementerian Pendidikan, Kebudayaan, Riset, dan Teknologi, serta kekhasan kurikulum keagamaan dari **Kementerian Agama Republik Indonesia**.

Hal ini bertujuan untuk menghasilkan lulusan yang tidak hanya cerdas di bidang ilmu pengetahuan umum dan teknologi, tetapi juga kuat dalam pengamalan nilai-nilai keislaman, berakhlakul karimah, serta memiliki karakter profil Pelajar Pancasila dan Pelajar Rahmatan Lil 'Alamin.